Abstract

頭部固定マウスにおいて,右前肢で操作可能なレバーを用いたオペラントコンディショニング課題を行った.課題学習中の背側大脳皮質神経活動,上半身・顔・眼球のビデオ記録,および行動・環境センサーの値を15セッション(30min/セッション)にわたって記録した.これに加え,オペラントコンディショニング開始から起算して−1,1,7,15セッション目の行動課題後に,安静時脳活動を記録した(10min/セッション).オペラントコンディショニング開始から起算して16セッション目には,麻酔下条件で感覚刺激応答を記録した(15min).本実験において、Ca2+センサーと広視野1光子顕微鏡(Wide-field 1p)により背側大脳皮質全体の神経活動を計測した。さらにマウスの上半身・顔・眼球のビデオ記録ビデオデータ(Body/Face/Eye Camera)を行った。またマウスの行動データとしてレバー位置,舌なめ(licking)に加え,報酬や音刺激提示のタイミングを計測した(Behavior data)。本サンプルデータ公開は,全25個体ぶんのデータ公開に先駆けて1個体の全セッションのデータを①生データ(記録された状態のままのデータ)および②前処理済みデータ(すぐ解析に使用できるよう定型的な処理を施したデータ)の双方を,Creative Commonsライセンスで提供するものである。

【免責】本サンプルデータは,将来予定されている全個体ぶんのデータ公開において予定されているものと同様のデータフォーマットで作成されているが,前処理済みデータについてはクオリティアップのための処理方法の変更などに起因する差異が生じる可能性がある。不明点がある場合は総括班まで連絡してください。

スクリーンショット 2024-08-08 1.54.26.png

Sample dataset

NWB processed dataset (Recommended)

<aside> 💡 All NWB dataset (46GB):https://www.dropbox.com/scl/fo/lm6mdu4j7egraynkfir7g/AOchoUWzlYLqsUHJvDOjT5M?rlkey=48nmrnfa0sm8y43w3c172kzcv&dl=0

Day 1 resting state:https://www.dropbox.com/scl/fi/4t2liwobfq1uy81sqrmk8/VG1GC-61_2023-06-15_resting-state-day1.nwb?rlkey=gnnytl3lv53xlskr8afa1mo8r&dl=0 Day 1: https://www.dropbox.com/scl/fi/3jbphtwfjmcvmwlfeihpk/VG1GC-61_2023-06-15_task-day1.nwb?rlkey=4s991iftx7l4xdrf9f30hfpwf&dl=0 Day 2:https://www.dropbox.com/scl/fi/nqxu9x28jxy0uh04921h7/VG1GC-61_2023-06-16_task-day2.nwb?rlkey=9e4hbwkv6vprdnoahl8mpzy6w&dl=0 Day 3:https://www.dropbox.com/scl/fi/lauidpgvidmowblgshkaj/VG1GC-61_2023-06-19_task-day3.nwb?rlkey=ndxbqsjnmdjapjhl28hmdpska&dl=0 Day 4:https://www.dropbox.com/scl/fi/tkqmf4s9oja8dzubchk0s/VG1GC-61_2023-06-20_task-day4.nwb?rlkey=1et2hsri9ybj516dunwgrta09&dl=0 Day 5:https://www.dropbox.com/scl/fi/rlcxky5yw2ewxo8acyuxs/VG1GC-61_2023-06-21_task-day5.nwb?rlkey=wy9qam4nk0xbdmcv5ks5zn9ac&dl=0 Day 6:https://www.dropbox.com/scl/fi/uzuvb80ie7u31h83xjku0/VG1GC-61_2023-06-22_task-day6.nwb?rlkey=jcphvxi74vwcgm591wi4wm1rq&dl=0 Day 7 resting state:https://www.dropbox.com/scl/fi/plsveiru8zniwbok9fz2k/VG1GC-61_2023-06-23_resting-state-day7.nwb?rlkey=7d4s5oojwqur9m4ujugjabd37&dl=0 Day 7:https://www.dropbox.com/scl/fi/vmgwj9ermuzj6st0ow4m6/VG1GC-61_2023-06-23_task-day7.nwb?rlkey=bh1psajutux933qclu6cubfq5&dl=0 Day 8:https://www.dropbox.com/scl/fi/shjkpe05fbsfo7nqnhqay/VG1GC-61_2023-06-26_task-day8.nwb?rlkey=ekpuf7sgut3pb3op8wfdx4e3n&dl=0 Day 9:https://www.dropbox.com/scl/fi/ctql6xqveq9si06v8wi6p/VG1GC-61_2023-06-27_task-day9.nwb?rlkey=e0et3m5sq3zwjw04bxr6w1yh8&dl=0 Day 10:https://www.dropbox.com/scl/fi/h4pikm51j0j01clds39ij/VG1GC-61_2023-06-28_task-day10.nwb?rlkey=tq7qdzl92iiede45m98obu4zv&dl=0 Day 11:https://www.dropbox.com/scl/fi/g5m813otmzsomg2iw4l6g/VG1GC-61_2023-06-29_task-day11.nwb?rlkey=tdriw72ng1lj7p4k9tob7imkt&dl=0 Day 12:https://www.dropbox.com/scl/fi/u0qz3ccmgyylyamcrejue/VG1GC-61_2023-06-30_task-day12.nwb?rlkey=vgdc8yvtf2j15meujqne3lhtl&dl=0 Day 13:https://www.dropbox.com/scl/fi/5jf98ru2wo31sf09dc21m/VG1GC-61_2023-07-03_task-day13.nwb?rlkey=etlvad8zd32qvns3pjp8vt0ei&dl=0 Day 14:https://www.dropbox.com/scl/fi/n8qjjsfxqxlb5oge43caq/VG1GC-61_2023-07-04_task-day14.nwb?rlkey=r16rtvtjpnewjwkpawchl9ahe&dl=0 Day 15 restinga state:https://www.dropbox.com/scl/fi/gf8yvxompaeaodecg074u/VG1GC-61_2023-07-05_resting-state-day15.nwb?rlkey=oe3uw8z0n6xenuv2wont3wl8v&dl=0 Day 15:https://www.dropbox.com/scl/fi/czgo66wwqd18e4aytc5rq/VG1GC-61_2023-07-05_task-day15.nwb?rlkey=1ao49fbejkpnw4sczys7h7fhx&dl=0

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All dataset (15 task and 3 resting state of NWB, Wide-field 1 photon images**, Face and body movies) 800GB程度**

<aside> 💡 https://www.dropbox.com/scl/fo/ve6gu87i28h245af854ho/AAhBEGs2XqYRftr6toEL7Bs?rlkey=fx9gxe89pqx73tedqcg79ydc4&dl=0

スクリーンショット 2024-08-08 22.00.59.png

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データの詳細はData Descriptionを参照のこと。

Data License

This sample dataset is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Tutorial

Python Tutorial: NWBからPeri-Event Time Histogram作成

MATLAB Tutorial: NWBからPeri-Event Time Histogram作成

Data description

Methods